1. 重組慢病毒的制備
Day1: 匯合度90%的10cm dishs HEK293T細(xì)胞(~ 6×107/dish)按1:1比例傳代至15cm dishs,第二天細(xì)胞匯合度達(dá)到90%-95%(~ 1.5×108/dish),培養(yǎng)基為Gibico高糖DMEM培養(yǎng)基(含10%FBS)。
Day2: 轉(zhuǎn)染前2-3個(gè)小時(shí)更換培養(yǎng)基(含10%FBS);
2)按照以下比例配制轉(zhuǎn)染試劑:
Mix 1體積μlMix 2量DMEM(無(wú)FBS)1000μlDMEM(無(wú)FBS)1000μl目的基因質(zhì)粒25μgVGF190μl(1μg/μl)PMD2G7.5μgPSPAX215μg
Mix 1和Mix 2分別混合后,室溫5-10min, 后將Mix 1和Mix 2混合,室溫30min,加入至15cm dish中。(細(xì)胞達(dá)到匯合度90%,細(xì)胞過(guò)少會(huì)影響轉(zhuǎn)染效率)
Day3: 6h-24h內(nèi)更換新鮮培養(yǎng)基(含10%FBS),觀察轉(zhuǎn)染效率并拍照。
Day5: 72h觀察細(xì)胞狀態(tài)并拍照。收取上清培養(yǎng)基,過(guò)0.45μm濾膜,上清培養(yǎng)基加入超速離心管中,配平后離心,25000rpm,4℃離心1.5h。棄上清,用適當(dāng)病毒保存液回溶混勻溶解過(guò)夜。
Day6:收集病毒分裝,進(jìn)行病毒滴度測(cè)定。
2. 重組慢病毒滴度測(cè)定
2.1 整合數(shù)法標(biāo)定不帶熒光的重組慢病毒滴度
2.1.1 病毒感染細(xì)胞
①感染前6 h 在24孔細(xì)胞培養(yǎng)板中以2.5×105個(gè)細(xì)胞/孔 均勻接種HEK293細(xì)胞。
②將慢病毒進(jìn)行梯度稀釋,共做3個(gè)梯度,即每孔(500μl 無(wú)雙抗、無(wú)血清的DMEM培養(yǎng)基)中含10 μl、1 μl、0.1 μl 病毒,振蕩混勻后加至接種好細(xì)胞的24孔板中,加病毒之前將培養(yǎng)板中的培養(yǎng)基吸凈。
③感染 18-20h 后,將培養(yǎng)板中的培養(yǎng)基更換為新鮮的DMEM完培。
④感染 64-68h 后收集細(xì)胞并進(jìn)行基因組DNA的提取。
⑤測(cè)定時(shí),設(shè)置一組帶熒光的已知TU的慢病毒作為對(duì)照,以校驗(yàn)檢測(cè)出的數(shù)值。
2.1.2 提取基因組DNA(按照AxyGEN 的基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行操作)
2.1.3 qPCR檢測(cè)
① 以被測(cè)慢病毒載體梯度稀釋為標(biāo)準(zhǔn)品,慢病毒載體上的通用引物進(jìn)行qPCR以獲得病毒整合拷貝數(shù)。
② 以Actin質(zhì)粒梯度稀釋為標(biāo)準(zhǔn)品,Actin引物進(jìn)行qPCR檢測(cè)樣品的基因組拷貝數(shù)以得到基因組拷貝數(shù)。
③ qPCR
qPCR反應(yīng)體系如下:
組成成分體積2 × SYBR Green mix10 μlPrimers (Forward & Reverse mixture)0.8 μl超純水(DNase & RNase Free)7.2μl模板2μlTotal20μl
qPCR反應(yīng)程序:
循環(huán)參數(shù)預(yù)變性95℃ 3min;95℃ 5S;60℃ 15S;72℃ 15S+Plate Read39個(gè)循環(huán)
2.1.4 計(jì)算慢病毒IU(Integration Unit)/ml
IU/ml=(C×N×D×1000)/V
注:C=平均每基因組慢病毒整合拷貝數(shù)D=病毒的稀釋倍數(shù)N=感染時(shí)細(xì)胞的數(shù)目(約為2.5×10E5)V=加入稀釋病毒的體積數(shù)
2.2 孔稀釋法標(biāo)定帶熒光的重組慢病毒滴度
Day1: 細(xì)胞的準(zhǔn)備
在96孔板中的每個(gè)孔中接種1-4×104個(gè) HEK293細(xì)胞。
Day2: 病毒的稀釋與感染
在Eppendorf管中做10倍梯度稀釋,分別是1~10-6梯度。棄去96孔板中原有的培養(yǎng)基,將稀釋好的病毒依次加入孔中,注意是兩個(gè)重復(fù),并做好標(biāo)記。
Day5: 熒光計(jì)數(shù)與滴度計(jì)算
感染72h后,用熒光顯微鏡對(duì)熒光陽(yáng)性細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)。數(shù)出最后兩孔的熒光細(xì)胞數(shù),計(jì)算2個(gè)重復(fù)孔內(nèi)的總數(shù)之和并計(jì)算出平均數(shù),假設(shè)為A(倒數(shù)第二孔的熒光細(xì)胞平均數(shù))和B(倒數(shù)第一孔的熒光細(xì)胞平均數(shù))。
慢病毒滴度計(jì)算公式:病毒滴度 (TU/ml) = (A+B×10)×1000/2/A孔病毒量(μl)
3. 慢病毒的使用
3.1 重組慢病毒體外感染細(xì)胞
不同的細(xì)胞所使用的病毒MOI值會(huì)有所不同。建議在正式實(shí)驗(yàn)前,在目的細(xì)胞中進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)摸索最佳MOI值。
3.1.1 慢病毒感染目的細(xì)胞預(yù)實(shí)驗(yàn)
為了節(jié)省病毒,推薦使用96孔板進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)。操作步驟如下:
①Day1 細(xì)胞的準(zhǔn)備
將目的細(xì)胞接種于96孔板中,細(xì)胞融合率為50%為最佳。為保證細(xì)胞生長(zhǎng)良好,請(qǐng)保證細(xì)胞貼壁過(guò)夜。
②Day2 病毒的稀釋
取10μL慢病毒原液加入90μL培養(yǎng)液中做1:10稀釋(10-1),以此為起點(diǎn)做梯度稀釋直至稀釋10-7??筛鶕?jù)實(shí)際情況降低或提高稀釋倍數(shù)。
③Day2 感染目的細(xì)胞
取出提前準(zhǔn)備好的96孔板,用準(zhǔn)備好的病毒稀釋液替代舊培養(yǎng)液,注意保留未加入病毒的細(xì)胞孔作為對(duì)照組。
④第Day2~Day10 觀察熒光或檢測(cè)
慢病毒對(duì)細(xì)胞的感染較慢,請(qǐng)?jiān)诟腥炯?xì)胞后48、72、96、120小時(shí)分別觀察細(xì)胞中熒光表達(dá)情況(如果您選擇的產(chǎn)品不帶有熒光標(biāo)簽,請(qǐng)?jiān)?/span>48、72、96、120小時(shí)分別收獲細(xì)胞并通過(guò) Western-Blot 或其他檢測(cè)手段來(lái)檢測(cè)基因表達(dá))。
注意:由于不同細(xì)胞對(duì)慢病毒感染過(guò)程的承受能力不同,在加入病毒稀釋液后,請(qǐng)于12-24小時(shí)后觀察細(xì)胞狀態(tài)以確認(rèn)加入的病毒量是否合適。
3.1.2 慢病毒感染目的細(xì)胞
進(jìn)行慢病毒感染實(shí)驗(yàn)時(shí)可使用完培(培養(yǎng)目的細(xì)胞用)稀釋。培養(yǎng)液中的血清、雙抗或其他營(yíng)養(yǎng)因子不會(huì)影響慢病毒的感染效率。
以24 孔培養(yǎng)板為例,進(jìn)行HEK293細(xì)胞的感染實(shí)驗(yàn)操作步驟如下:
注意:實(shí)驗(yàn)前請(qǐng)按照不同的MOI 設(shè)置不同的感染孔,并根據(jù)MOI 和細(xì)胞數(shù)量計(jì)算所需要的病毒量。
最適病毒用量的計(jì)算公式:病毒用量TU=最佳MOI×細(xì)胞數(shù)目/病毒滴度
例如, 如果您目的細(xì)胞的最佳MOI=10,您需要感染106的細(xì)胞,那么您共計(jì)需要107 TU的病毒. 如果病毒滴度為1×108 TU/mL, 那么您實(shí)驗(yàn)需要的病毒量就是100μL.
① Day1 細(xì)胞的準(zhǔn)備
在24孔培養(yǎng)板接種若干孔,每個(gè)孔內(nèi)接種3-5×104個(gè)HEK 293細(xì)胞,鋪板時(shí)細(xì)胞的融合率為50%左右,每孔培養(yǎng)液體積為300μL,進(jìn)行病毒感染時(shí)細(xì)胞的匯合度約為70%。
②Day2 病毒的準(zhǔn)備
根據(jù)實(shí)驗(yàn)的實(shí)際情況和MOI 值,用培養(yǎng)液準(zhǔn)確稀釋慢病毒原液。
注意:可使用PBS緩沖液或無(wú)血清培養(yǎng)液稀釋病毒原液。
③Day2 感染目的細(xì)胞
在目的細(xì)胞和對(duì)照細(xì)胞中分別加入計(jì)算好的病毒液, 混勻后放于CO2培養(yǎng)箱(37 ℃、5% CO2)孵育過(guò)夜。
注意:1)感染前細(xì)胞的狀態(tài)好壞對(duì)最終的感染效果高低影響很大,請(qǐng)務(wù)必保證加入病毒前,細(xì)胞處于良好的生長(zhǎng)狀態(tài)。
2)若慢病毒對(duì)目的細(xì)胞的感染效率較低,可通過(guò)提高MOI 值提高病毒的感染效率,也可在培養(yǎng)液中加入維真生物助感染試劑ADV-HR來(lái)提高病毒的感染效率。
④Day3 更換培養(yǎng)液
病毒感染細(xì)胞24小時(shí)后,更換培養(yǎng)液。
注意:換液具體時(shí)間需視細(xì)胞狀態(tài)而定。如果慢病毒對(duì)細(xì)胞有明顯毒性作用,影響細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài),最短可于加病毒4小時(shí)后更換新鮮培養(yǎng)液后繼續(xù)培養(yǎng)。
⑤Day6 感染效率檢測(cè)
在倒置熒光顯微鏡觀察熒光,計(jì)算慢病毒感染目的細(xì)胞的效率。如選擇的慢病毒載體不帶有熒光標(biāo)記,可以通過(guò)Q-PCR(定量PCR)檢測(cè)目的基因的表達(dá)來(lái)評(píng)估感染效率。
注意:1)慢病毒表達(dá)較慢,熒光表達(dá)所需時(shí)間較長(zhǎng),建議感染96小時(shí)后觀察熒光的表達(dá)。
2)感染后的細(xì)胞可以連續(xù)培養(yǎng)一周,通過(guò)觀察熒光表達(dá)的時(shí)間和強(qiáng)度來(lái)確定慢病毒對(duì)目的細(xì)胞的感染情況。
3)感染期間,請(qǐng)根據(jù)細(xì)胞生長(zhǎng)的情況及時(shí)換液,以保證細(xì)胞良好的生長(zhǎng)狀態(tài)。
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2、可以滿足不同細(xì)胞的穩(wěn)轉(zhuǎn)的需求;
3、攜帶抗性用于穩(wěn)轉(zhuǎn)構(gòu)建;
4、表達(dá)穩(wěn)定適合用于基因敲除;
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